Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Amigo1Q80ZD8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Amigo1Q80ZD8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Amigo1Q80ZD8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Amigo1Q80ZD8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Amigo1Q80ZD8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Amigo1Q80ZD8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Amigo1Q80ZD8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Amigo1Q80ZD8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Amigo1Q80ZD8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Amigo1Q80ZD8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Amigo1Q80ZD8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Amigo1Q80ZD8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Amigo1Q80ZD8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Amigo1Q80ZD8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Amigo1Q80ZD8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Amigo1Q80ZD8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Amigo1Q80ZD8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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