Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TnnQ80Z71 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TnnQ80Z71 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TnnQ80Z71 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
TnnQ80Z71 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
TnnQ80Z71 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TnnQ80Z71 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TnnQ80Z71 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TnnQ80Z71 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TnnQ80Z71 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
TnnQ80Z71 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
TnnQ80Z71 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TnnQ80Z71 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TnnQ80Z71 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
TnnQ80Z71 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TnnQ80Z71 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TnnQ80Z71 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TnnQ80Z71 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TnnQ80Z71 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TnnQ80Z71 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TnnQ80Z71 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TnnQ80Z71 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TnnQ80Z71 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TnnQ80Z71 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TnnQ80Z71 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TnnQ80Z71 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TnnQ80Z71 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TnnQ80Z71 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TnnQ80Z71 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms