Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8Q80YR6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8Q80YR6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8Q80YR6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8Q80YR6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8Q80YR6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8Q80YR6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8Q80YR6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8Q80YR6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp8Q80YR6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp8Q80YR6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp8Q80YR6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp8Q80YR6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp8Q80YR6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp8Q80YR6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp8Q80YR6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp8Q80YR6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp8Q80YR6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbbp8Q80YR6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbbp8Q80YR6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbbp8Q80YR6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp8Q80YR6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rbbp8Q80YR6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rbbp8Q80YR6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rbbp8Q80YR6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp8Q80YR6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp8Q80YR6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp8Q80YR6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp8Q80YR6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp8Q80YR6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp8Q80YR6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp8Q80YR6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp8Q80YR6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp8Q80YR6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms