Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zbed4Q80WQ9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms