Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Npm2Q80W85 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Npm2Q80W85 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Npm2Q80W85 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Npm2Q80W85 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Npm2Q80W85 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Npm2Q80W85 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Npm2Q80W85 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Npm2Q80W85 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Npm2Q80W85 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Npm2Q80W85 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Npm2Q80W85 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Npm2Q80W85 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Npm2Q80W85 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Npm2Q80W85 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Npm2Q80W85 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Npm2Q80W85 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Npm2Q80W85 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Npm2Q80W85 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Npm2Q80W85 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Npm2Q80W85 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Npm2Q80W85 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Npm2Q80W85 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Npm2Q80W85 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Npm2Q80W85 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Npm2Q80W85 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Npm2Q80W85 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Npm2Q80W85 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Npm2Q80W85 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Npm2Q80W85 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Npm2Q80W85 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Npm2Q80W85 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Npm2Q80W85 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Npm2Q80W85 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Npm2Q80W85 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Npm2Q80W85 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Npm2Q80W85 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Npm2Q80W85 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Npm2Q80W85 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Npm2Q80W85 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Npm2Q80W85 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Npm2Q80W85 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Npm2Q80W85 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Npm2Q80W85 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Npm2Q80W85 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Npm2Q80W85 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Npm2Q80W85 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms