Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ell3Q80VR2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms