Protein–RNA interactions for Protein: Q80TQ2

Cyld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, mousemouse

Predictions only

Length 952 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CyldQ80TQ2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CyldQ80TQ2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CyldQ80TQ2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms