Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl29Q80T74 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms