Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube2q1Q7TSS2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube2q1Q7TSS2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube2q1Q7TSS2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube2q1Q7TSS2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube2q1Q7TSS2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube2q1Q7TSS2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube2q1Q7TSS2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube2q1Q7TSS2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube2q1Q7TSS2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube2q1Q7TSS2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube2q1Q7TSS2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube2q1Q7TSS2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube2q1Q7TSS2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube2q1Q7TSS2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2q1Q7TSS2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2q1Q7TSS2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2q1Q7TSS2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2q1Q7TSS2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2q1Q7TSS2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2q1Q7TSS2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2q1Q7TSS2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2q1Q7TSS2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2q1Q7TSS2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2q1Q7TSS2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2q1Q7TSS2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2q1Q7TSS2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2q1Q7TSS2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ube2q1Q7TSS2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2q1Q7TSS2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms