Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ClmQ7TSN2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms