Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccp110Q7TSH4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms