Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dsg1bQ7TSF1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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