Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dsg1cQ7TSF0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms