Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek5Q7TSC3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek5Q7TSC3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek5Q7TSC3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek5Q7TSC3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek5Q7TSC3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek5Q7TSC3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek5Q7TSC3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek5Q7TSC3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms