Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms