Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rpf1Q7TND5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms