Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms