Protein–RNA interactions for Protein: Q7M764

Usp17le, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein E, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17leQ7M764 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17leQ7M764 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp17leQ7M764 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp17leQ7M764 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp17leQ7M764 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp17leQ7M764 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp17leQ7M764 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp17leQ7M764 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp17leQ7M764 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp17leQ7M764 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp17leQ7M764 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp17leQ7M764 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp17leQ7M764 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp17leQ7M764 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp17leQ7M764 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms