Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smim12Q78RX3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms