Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eci3Q78JN3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms