Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms