Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpv1Q704Y3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms