Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube2d2bQ6ZWY6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms