Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SpopQ6ZWS8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 358.1 ms