Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ncapd3Q6ZQK0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ncapd3Q6ZQK0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Ncapd3Q6ZQK0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ncapd3Q6ZQK0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ncapd3Q6ZQK0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ncapd3Q6ZQK0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ncapd3Q6ZQK0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ncapd3Q6ZQK0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ncapd3Q6ZQK0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ncapd3Q6ZQK0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC31.39■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Ncapd3Q6ZQK0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ncapd3Q6ZQK0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ncapd3Q6ZQK0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ncapd3Q6ZQK0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ncapd3Q6ZQK0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ncapd3Q6ZQK0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ncapd3Q6ZQK0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ncapd3Q6ZQK0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms