Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nup188Q6ZQH8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup188Q6ZQH8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup188Q6ZQH8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup188Q6ZQH8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup188Q6ZQH8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup188Q6ZQH8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup188Q6ZQH8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup188Q6ZQH8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup188Q6ZQH8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup188Q6ZQH8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup188Q6ZQH8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup188Q6ZQH8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup188Q6ZQH8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms