Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ89

March6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March6Q6ZQ89 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
March6Q6ZQ89 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms