Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

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Length 800 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
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Chsy1Q6ZQ11 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Chsy1Q6ZQ11 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Chsy1Q6ZQ11 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Chsy1Q6ZQ11 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Chsy1Q6ZQ11 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Chsy1Q6ZQ11 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Chsy1Q6ZQ11 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chsy1Q6ZQ11 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chsy1Q6ZQ11 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chsy1Q6ZQ11 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chsy1Q6ZQ11 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chsy1Q6ZQ11 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chsy1Q6ZQ11 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chsy1Q6ZQ11 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chsy1Q6ZQ11 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chsy1Q6ZQ11 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chsy1Q6ZQ11 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chsy1Q6ZQ11 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chsy1Q6ZQ11 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chsy1Q6ZQ11 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Chsy1Q6ZQ11 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chsy1Q6ZQ11 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chsy1Q6ZQ11 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chsy1Q6ZQ11 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chsy1Q6ZQ11 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chsy1Q6ZQ11 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chsy1Q6ZQ11 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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