Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smpd4Q6ZPR5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms