Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LcorQ6ZPI3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms