Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M2Q6W9L1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M2Q6W9L1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M2Q6W9L1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M2Q6W9L1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M2Q6W9L1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M2Q6W9L1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M2Q6W9L1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M2Q6W9L1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M2Q6W9L1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M2Q6W9L1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M2Q6W9L1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M2Q6W9L1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M2Q6W9L1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M2Q6W9L1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M2Q6W9L1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M2Q6W9L1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M2Q6W9L1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M2Q6W9L1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M2Q6W9L1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M2Q6W9L1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M2Q6W9L1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M2Q6W9L1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M2Q6W9L1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-M2Q6W9L1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-M2Q6W9L1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M2Q6W9L1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms