Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn5Q6VZZ7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn5Q6VZZ7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn5Q6VZZ7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn5Q6VZZ7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn5Q6VZZ7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Opn5Q6VZZ7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Opn5Q6VZZ7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Opn5Q6VZZ7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms