Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ift172Q6VH22 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ift172Q6VH22 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ift172Q6VH22 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ift172Q6VH22 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ift172Q6VH22 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ift172Q6VH22 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ift172Q6VH22 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Ift172Q6VH22 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ift172Q6VH22 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ift172Q6VH22 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ift172Q6VH22 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ift172Q6VH22 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ift172Q6VH22 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ift172Q6VH22 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ift172Q6VH22 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ift172Q6VH22 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ift172Q6VH22 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ift172Q6VH22 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ift172Q6VH22 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ift172Q6VH22 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ift172Q6VH22 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ift172Q6VH22 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ift172Q6VH22 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ift172Q6VH22 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ift172Q6VH22 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ift172Q6VH22 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ift172Q6VH22 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ift172Q6VH22 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ift172Q6VH22 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ift172Q6VH22 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ift172Q6VH22 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ift172Q6VH22 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms