Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms