Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms