Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHU5

Sort1, Sortilin, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sort1Q6PHU5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sort1Q6PHU5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sort1Q6PHU5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.1 ms