Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx13Q6PHS6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms