Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad54bQ6PFE3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad54bQ6PFE3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad54bQ6PFE3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad54bQ6PFE3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rad54bQ6PFE3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad54bQ6PFE3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms