Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup98Q6PFD9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms