Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF93

Pik3c3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c3Q6PF93 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pik3c3Q6PF93 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pik3c3Q6PF93 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms