Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Gapvd1Q6PAR5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Gapvd1Q6PAR5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Gapvd1Q6PAR5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Gapvd1Q6PAR5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Gapvd1Q6PAR5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Gapvd1Q6PAR5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Gapvd1Q6PAR5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Gapvd1Q6PAR5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Gapvd1Q6PAR5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Gapvd1Q6PAR5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Gapvd1Q6PAR5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Gapvd1Q6PAR5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Gapvd1Q6PAR5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Gapvd1Q6PAR5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Gapvd1Q6PAR5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Gapvd1Q6PAR5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Gapvd1Q6PAR5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Gapvd1Q6PAR5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Gapvd1Q6PAR5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Gapvd1Q6PAR5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Gapvd1Q6PAR5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Gapvd1Q6PAR5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Gapvd1Q6PAR5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Gapvd1Q6PAR5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Gapvd1Q6PAR5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Gapvd1Q6PAR5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Gapvd1Q6PAR5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Gapvd1Q6PAR5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Gapvd1Q6PAR5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Gapvd1Q6PAR5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms