Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atl2Q6PA06 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms