Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc148Q6P5U8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms