Protein–RNA interactions for Protein: Q6P542

Abcf1, ATP-binding cassette sub-family F member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf1Q6P542 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Abcf1Q6P542 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms