Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Atg2aQ6P4T0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms