Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2K6

Ppp4r3a, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3aQ6P2K6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp4r3aQ6P2K6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms