Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrimpolQ6P1E7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrimpolQ6P1E7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms