Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Slx4Q6P1D7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Slx4Q6P1D7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Slx4Q6P1D7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Slx4Q6P1D7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Slx4Q6P1D7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Slx4Q6P1D7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Slx4Q6P1D7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Slx4Q6P1D7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Slx4Q6P1D7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Slx4Q6P1D7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Slx4Q6P1D7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Slx4Q6P1D7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Slx4Q6P1D7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Slx4Q6P1D7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Slx4Q6P1D7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Slx4Q6P1D7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Slx4Q6P1D7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Slx4Q6P1D7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Slx4Q6P1D7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Slx4Q6P1D7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Slx4Q6P1D7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Slx4Q6P1D7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Slx4Q6P1D7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Slx4Q6P1D7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Slx4Q6P1D7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Slx4Q6P1D7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Slx4Q6P1D7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Slx4Q6P1D7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Slx4Q6P1D7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Slx4Q6P1D7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Slx4Q6P1D7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms