Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Soga3Q6NZL0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Soga3Q6NZL0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms