Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ptpdc1Q6NZK8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms